1、猪的品种不同：云腿所选择的猪腿是从云南当地散养的黑跑猪中选来的，其特点是纯天然饲养，而其他用于火腿的猪品种也不一样，比如金华火腿选用的是江浙地区的乌猪，而金华火腿则选用的是当地的乌猪。
2、云腿的种类不同：云腿只是指用猪后腿腌制的火腿，而其他种类腌制的也可称为火腿，如羊腿、牛腿、鸡腿等。
3、口味不同：云腿的制作方法是烟熏，所以吃烟熏能明显感受到，但其他种类的火腿制作方法各不相同，主要是腌、晒、发酵等。